Verschiedene Symptome wie etwa Durchfall, Blähbauch, Bauchschmerzen, Übelkeit, Gewichtsverlust, Müdigkeit, Eisenmangel, Ödeme, …etc. lassen eine erste Diagnose zu. Diese vorläufige Vermutung kann mit einer Antikörperdiagnose bestätigt werden. Vor allem für die Erstdiagnose bei Verdacht auf Zöliakie ist sie von großer Bedeutung. Als beweisend anerkannte Methode für Zöliakie ist eine sogenannte Gastroskopie (Magenspiegelung) mit Dünndarmbiopsie notwendig. Dadurch kann die, für die Zöliakie typische, Zottenatrophie nachgewiesen werden.